Геофизическая обсерватория, научно-исследовательское учреждение, занимающееся изучением отдельных вопросов геофизики. Первые Геофизическая обсерватория были созданы в Екатеринбурге (Свердловске) в 1836 и Тбилиси в 1837 как магнитно-метеорологические обсерватории для обеспечения горнодобывающей промышленности данными магнитных и метеорологических наблюдений.
В 1884 организована Геофизическая обсерватория в Иркутске, в 1912 — во Владивостоке. В 1849 была учреждена Главная физическая обсерватория в Петербурге (см. Главная геофизическая обсерватория), которая наряду с геофизическими исследованиями по обширной программе осуществляла научно-методическое руководство обсерваториями и метеорологическими станциями. В годы Советской властиГеофизическая обсерватория организованы в Киеве, Минске, Одессе, Куйбышеве, Ташкенте, Алма-Ате и др.
В 1940 в связи с возросшими запросами народного хозяйства руководство работами по земному магнетизму было возложено на вновь созданный Институт земного магнетизма (ныне Научно-исследовательский институт земного магнетизма, ионосферы и распространения радиоволн АН СССР), который руководит специальными магнитными и ионосферными обсерваториями и станциями.
Геофизическая обсерватория, находившиеся в ведении Главного управления гидрометеорологической службы, преобразованы в гидрометеорологические обсерватории.